Az előtört bölcsességfogak pozíciójából adódóan gyakran előfordul, hogy a páciens nehezen fér hozzájuk, így a tisztításuk komplikálttá, esetleg lehetetlenné válik. Ebből adódóan a bölcsességfogak hajlamosabbak a fogszuvasodásra, előrehaladott állapotban a fogbél gyulladására. Anatómiai sokszínűségüknek köszönhetően nehezen megoldható a fogak konzervatív terápiája, így az esetek nagy részében az adott bölcsességfog eltávolítása javallott. Részben előtört bölcsességfogak esetében a tisztítás még inkább megvalósíthatatlan, ilyen esetekben az előbb felsorolt következményes betegségeken kívül a lágy részek gyulladása is felléphet a fog koronája körül. Ez a folyamat fájdalmas gyulladással, duzzanattal, szájzárral és általános tünetekkel, például hőemelkedéssel, lázzal is járhat.

Amennyiben a bölcsességfog részben vagy teljes mértékben lágy szövettel, ínnyel fedett, esetleg mélyebben az állcsontban található, úgy szükségessé válik a bölcsességfog műtéti eltávolítása. A műtéti beavatkozást minden esetben röntgendiagnosztika előzi meg. Rutinszerűen a műtét helyi érzéstelenítésben, fájdalommentesen történik. A fogat felszabadítjuk a lágy szövetek alól, majd esetenként kevés csont elvételével hozzáférhetővé tesszük. Ezután egy, vagy több darabban történik a bölcsességfog kiemelése az adott állcsontból. A fogeltávolítás után varratot helyezünk be, melyet egy hét gyógyulási idő után távolítunk el a műtéti területről.